Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DAP3P51398 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DAP3P51398 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DAP3P51398 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DAP3P51398 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DAP3P51398 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms