Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK7P50613 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK7P50613 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK7P50613 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK7P50613 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK7P50613 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK7P50613 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK7P50613 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK7P50613 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK7P50613 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK7P50613 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK7P50613 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK7P50613 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK7P50613 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK7P50613 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms