Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1DP48730 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms