Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARCN1P48444 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARCN1P48444 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARCN1P48444 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARCN1P48444 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARCN1P48444 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARCN1P48444 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARCN1P48444 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARCN1P48444 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms