Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms