Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA8P48165 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA8P48165 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJA8P48165 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJA8P48165 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA8P48165 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA8P48165 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms