Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER2P43116 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms