Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms