Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHI3L1P36222 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms