Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms