Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms