Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms