Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND3P30281 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND3P30281 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND3P30281 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND3P30281 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND3P30281 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND3P30281 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND3P30281 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND3P30281 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND3P30281 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND3P30281 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms