Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5DP30049 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms