Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PTPRMP28827 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms