Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX2P28328 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX2P28328 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX2P28328 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX2P28328 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX2P28328 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX2P28328 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX2P28328 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX2P28328 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms