Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4AP27815 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4AP27815 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms