Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMLP26374 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMLP26374 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMLP26374 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMLP26374 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMLP26374 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms