Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD2P25440 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD2P25440 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD2P25440 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRD2P25440 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD2P25440 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD2P25440 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD2P25440 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD2P25440 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD2P25440 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD2P25440 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD2P25440 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD2P25440 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD2P25440 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD2P25440 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms