Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM3P25205 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM3P25205 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM3P25205 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms