Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE1P24864 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms