Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPREP23469 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPREP23469 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPREP23469 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPREP23469 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPREP23469 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPREP23469 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPREP23469 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPREP23469 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPREP23469 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPREP23469 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms