Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms