Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ATF3P18847 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF3P18847 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF3P18847 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF3P18847 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF3P18847 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF3P18847 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF3P18847 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF3P18847 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF3P18847 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF3P18847 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF3P18847 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF3P18847 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms