Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms