Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAP43P17677 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAP43P17677 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAP43P17677 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAP43P17677 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAP43P17677 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAP43P17677 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAP43P17677 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAP43P17677 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAP43P17677 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms