Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB3P16520 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB3P16520 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB3P16520 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms