Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6AP16499 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms