Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms