Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA1P15976 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA1P15976 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms