Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF4P15884 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF4P15884 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF4P15884 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF4P15884 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF4P15884 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms