Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC5A1P13866 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A1P13866 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms