Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT1P13805 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms