Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
COX4I1P13073 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX4I1P13073 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms