Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP3P12645 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BMP3P12645 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BMP3P12645 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP3P12645 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP3P12645 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP3P12645 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP3P12645 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP3P12645 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP3P12645 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP3P12645 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BMP3P12645 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms