Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRP12270 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRP12270 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRP12270 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRP12270 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRP12270 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRP12270 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRP12270 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRP12270 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRP12270 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRP12270 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRP12270 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRP12270 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRP12270 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRP12270 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRP12270 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms