Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL11A1P12107 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms