Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNAT1P11488 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNAT1P11488 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms