Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGF3P11487 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGF3P11487 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGF3P11487 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGF3P11487 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGF3P11487 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms