Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARBP10826 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARBP10826 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARBP10826 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARBP10826 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARBP10826 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARBP10826 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARBP10826 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARBP10826 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARBP10826 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARBP10826 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARBP10826 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARBP10826 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms