Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRFP10586 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms