Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms