Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms