Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
PARP1P09874 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP1P09874 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP1P09874 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP1P09874 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP1P09874 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP1P09874 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP1P09874 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP1P09874 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP1P09874 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms