Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP10P09238 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP10P09238 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP10P09238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP10P09238 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP10P09238 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP10P09238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP10P09238 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP10P09238 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP10P09238 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP10P09238 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP10P09238 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP10P09238 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms