Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP3A4P08684 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms