Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFMP07197 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFMP07197 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFMP07197 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFMP07197 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFMP07197 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms