Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPLP06858 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPLP06858 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPLP06858 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPLP06858 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPLP06858 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPLP06858 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPLP06858 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LPLP06858 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LPLP06858 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPLP06858 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms