Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2AP05549 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAP2AP05549 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms