Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDN1P05305 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDN1P05305 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDN1P05305 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms